无论是高碳模式，还是低碳模式，都是用菌的模式，只不过所用的菌有所不同；
     高碳模式的菌：只要是个异养细菌都可以用，例如枯草芽孢杆菌（芽孢杆菌的一种）-粪肠球菌（乳酸菌的一种）-酵母菌等等，凡是能高效繁殖，高速生长的菌种为优选；其特点就是大量消耗碳源，来吸收同化（吃）氨氮/亚盐；缺点是这些总氮最终仍然还留在养殖池中，不断积累于这些微生物细胞体内。
     低碳模式的菌：主要是自养细菌+半自养细菌；例如硝化细菌（完全的自养细菌）-反硝化细菌（半自养细菌），其特点是不需要碳源（硝化细菌），或需要的碳源极少（反硝化细菌），通过对氨氮的氧化（硝化作用），和对硝态氮（亚硝酸盐+硝酸盐）的还原（反硝化作用），来脱除氨氮/亚盐，且这些总氮，最终是变成了氮气，挥发到空气中去了，彻底离开的池塘水体。
    下面分别就高碳模式和低碳模式，各自的特点和原理，介绍如下：

一、高碳模式（即生物絮团法）
      高碳模式之——生物絮团的原理：吸收同化氨氮/亚盐（就是吃掉氨氮/亚盐）
      高碳模式——生物絮团法，有如下特点：
1、特点一，需要极高的碳源支持：
      吸收同化氨氮/亚盐（吃）的原理下，依赖的是微生物的分裂繁殖，1变2，2变4，4变8...........，动用的是微生物繁殖分裂所涉及到的全部生命活动，例如遗传信息DNA的转录-复制-到信息RNA-再到RNA的翻译（就是根据遗传信息，合成特定的菌体蛋白质和其他细胞物质），运用的是微生物全身的功能，并不断地以裂变方式增长繁殖，在这种模式下，微生物需要消耗大量的能量，而能量的来源就是碳水化合物（分解后产生的葡萄糖），也就是没有碳源的支持，这些微生物也吃不了氨氮/亚盐，碳源是吸收同化的前提条件。
      微生物不断的裂变繁殖，最终表现为形成大量的生物絮团，其所需要的碳氮比达到35比1，即需要消耗35份的碳源，才能吸收同化1份的氨氮/亚盐，即所谓的高碳养虾模式；
2、特点二，需要极高的溶氧支持：
      微生物在高速繁殖状态下，也是耗氧最多的时候，尤其是对数生长阶段，生成的生物絮团越多，需要消耗的溶氧越多，如果溶氧不能及时跟上，极有可能倒菌，它和倒藻一样可怕，会造成养虾系统的瞬间崩溃，包括氨氮/亚盐飙升，有害物质飙升增长，耗氧因子突然指数增长造成溶氧下降；
3、特点三，氨氮/亚盐的吸收有先后顺序：
      微生物会先吸收同化掉最喜欢的氨基酸态氮、小肽态氮，然后才会吃氨氮，然后是硝酸盐氮，最后才会吸收同化亚硝酸盐态氮，所以，亚硝酸盐是排到最后处理的；
4、特点四，必须及时排掉多余的絮团：必须换水或套水
      因为微生物在不断的繁殖，池水中的微生物絮团会越来越多，积累到一定的程度，必然会发生倒菌，换句话说，如果你不天天排掉多余的絮团，那么倒菌是必然发生的，因为絮团积累到一定程度，数量太多的时候，池水中的营养是不够它们消耗的，此时就必然倒菌，絮团全部突然死亡；倒菌的危害，前面第2点已经说过了，这里不再累述。
      那生物絮团一般要维持多少的絮团量呢，一般是3%以内，即用一个1000毫升的玻璃锥形量筒（杯）装1000毫升池水，静置沉淀30分钟后，观察底部沉淀的生物絮团量，不超过30毫升。
      如何才能避免倒菌呢？通常的做法是每天排掉多余的絮团，在工厂化生物絮团养虾中，是通过循环水沉淀池或微滤机过滤掉，在小棚养虾中，则是通过套水换水排掉，也就是说，采用生物絮团，您必须要有套水或换水的操作，否则是不可持续的；

二、低碳模式（即硝化和反硝化氮循环法）：
      低碳模式的原理：通过硝化细菌的硝化作用，将池塘中的氨氮转化成硝态氮（即亚硝酸盐+硝酸盐），再通过反硝化作用，将前面产生的硝态氮，分几步最终转化成氮气， 挥发到空气中去了，注意在这里最重要的一点是：挥发到空气中去了，彻底离开了你的水体。
      低碳模式的特点：
1、可以实现全程不换水或少换水：
      如前所述，氨氮/亚盐最终都变成了氮气，挥发到空气中去了，这些氮物质不会积累在你的池塘中，从而可以实现全程不换水，不象生物絮团高碳模式那样，被微生物吸收吃掉，不断积累在池塘中，不得不换水排掉部分絮团（得天天排）
2、可以实现低碳甚至无碳养虾：
      不需要微生物大量繁殖和裂变，无论是硝化作用，还是反硝化作用，动用的仅仅是微生物细胞所有功能中的极少部分的功能，它不要求硝化细菌或反硝化细菌不断繁殖，就可达到目的，就象理发师一样，剃了一个人的头发，接下来再剃第二个人的头发，永远只需要一个理发师就可以了，这就是生物催化剂的原理，为了实现彻底的硝化+反硝化作用，只需要动用硝化细菌和反硝化细菌体内的一部分遗传物质，或叫基因片段，只需要动用能产生硝化作用或反硝化作用的那一点点基因片段就可以了
      例如：硝化细菌只需要从基因片段中翻译出氨氧化酶这个片段就可以，反硝化作用只需要翻译出硝酸盐还原酶和亚硝酸盐还原酶，这此小的基因片段就可以，所以，它们消耗的能量极少，所需要的碳源也就极少，其中硝化细菌（自养细菌）根本不需要有机碳源，而反硝化细菌（半自养细菌）只需要3比1的碳氮比碳源量就可以，几乎可以说，虾粪和残留中的碳源就足够它们用的了；
3、消耗的溶氧少：
      硝化作用是消耗氧气的，在如东小棚的曝气部位会起大量的硝化作用（通常是附着于曝起来的泥浆颗粒上）；但由于它是高效的氨氧化催化反应（高效生物催化），并不是裂变繁殖，所以，消耗的溶氧其实并不多；
      而反硝化作用则是缺氧反硝化作用，根本不需要溶氧支持，如东小棚是泥塘，无论如何曝气，泥巴中总是有局部厌氧环境以供给缺氧反硝化细菌起作用的环境。
4、低碳模式下不挑食（氨氮/亚盐同时处理，没有顺序）
      例如：硝化作用就是专一挑氨氮来进行生物氧化催化处理的，而反硝化作用也是专一挑硝态氮来生物还原催化处理的，不存在喜欢不喜欢的差别，这也是生物酶催化反应的专一性决定的；
      这一点和生物絮团先吃氨基酸+小肽，后吃氨氮，最后吃亚硝酸盐的顺序，是存在巨大区别的。

5、如东小棚采用低碳模式的话，如何用菌呢
      如东小棚在针对氨氮/亚盐问题上+培藻养藻+防控弧菌保苗等用菌方法：
      ①前期氨氮/亚盐控制：使用“强微脱氮诀1号”150克/棚+“强微反硝化细菌”100克/棚组合，前期每4-5天用1次，用法是：直接用池水浸泡开后泼洒，或和饲料搅拌均匀后泼洒都可以，若想效果好，就分别加等量的红糖，再加红糖20倍的水，充气活化一夜，第二天早上泼洒；
      “强微脱氮诀1号”是以氨氧化细菌（异养硝化细菌）为主等的产品，适用于前期侧重于氨氮的处理。
      ②后期氨氮/亚盐控制：使用“强微生物脱硫剂”150克/棚+“强微反硝化细菌”100克/棚组合就可以，后期每3天用1次，用法同上；
      “强微生物脱硫剂”可处理后期硫化氢超标问题，同时我们在这个产品中添加了大量最新研发的好氧反硝化细菌复配到这个产品中了，从而有利于后期集中处理亚硝酸盐。
      ③培藻养藻低碳补碳：定期使用成本低廉的液态“发酵米糠和麦麸液”，前期每5天使用1次，中期每3天使用1次，后期天天使用，用量为3公斤/棚（液体的），用来强势培藻养藻（小棚藻类难培），以及在小棚超高密度养虾的情况下，适当提供反硝化作用碳源即可；
       “发酵麦麸或米糠液肥”的制作：1包强微豆粕发酵剂 + 1包强微靓水素 + 75-100公斤小麦麸（或精米糠）+ 食盐3公斤 + 500公斤水＋红糖（或葡萄糖或白糖）5公斤，夏天发酵2～5天，发酵到PH4左右即可，密封于阴凉处可保存一个月；味极酸有酒味，保存时间长后有些臭味是正常现象；
      ④保苗和控制弧菌：可以用王者归来（固态培养的粪肠球菌），每隔25天用1次，用量为1包王者归来用于2-3个小棚，可直接用池水浸泡后直接泼洒，或用等量红糖，加红糖量20倍的水，充气活化一晚上，第二天早上泼洒下去；
      这种固态培养工艺生产的粪肠球菌，目前也只有宜春强微公司生产，其特点是活力强，耐运输和保存，存活率高，维持时间足够长，相比于市场上用传统液态工艺生产的粪肠球菌来说，优势非常大；
      最后可以实现全程不换水（用菌方法得当的情况下）。