秸秆腐熟菌剂，是有机物料腐熟剂中的一种重要品种。它是指能加速农作物秸秆分解、腐熟的微生物活体制剂。有机物料腐熟菌剂是近10年来微生物肥料快速发展的一个新品种(朱昌雄等，2005)。目前在秸秆为主料的腐熟堆肥和直接还田中广泛应用，通过接种加速秸秆的腐熟分解。
但关于接种微生物对秸秆腐熟和堆肥进程及堆肥产品品质的效果，目前学术界仍有有不同的看法。尽管有些学者认为接种微生物对加快堆肥化进程或提高堆肥产品质量没有明显促进作用(马放，2003)，但多数人认为在人工条件下通过接种可提高堆肥微生物数量，从而加速堆肥反应进程(席北斗等，2001)。接种微生物的目的概括如下:a.提高堆肥初期微生物的群体，增强微生物的降解活性；b.缩短达到高温期的时间；c.扩大繁殖有分解有机物质能力强的微生物数量(李明，2005)。
牛俊玲等在堆肥中加入经过驯化构建的降解纤维素的复合菌系，该复合菌系对纤维素、半纤维素的降解都有较为明显的促进作用，同时可溶性糖和淀粉在堆肥初期的分解加速，使堆肥在60℃以上高温持续时间延长，从而有利于有机碳的分解，有效缩短了堆肥腐熟时间(牛俊玲等，2005)。
孙先锋等利用分离筛选出了4株猪粪堆肥菌种制成混合菌剂，进行城市污泥堆肥对比试验，结果显示，接菌处理在各项堆肥指标上明显优于未接菌的空白处理，自制菌与酵素菌在堆肥过程中具有非常相似的发酵能力，均能加快堆肥的升温速度，提高堆肥的最高温度，加快物料含水率的下降。说明自制菌不但可以应用于猪粪的堆肥发酵，在城市污泥高温堆肥方而也有很好的应用潜力(孙先锋等，2006)。
徐大勇等采用传统培养方法和PCR一DGGE技术研究了人工接种堆肥和自然堆肥微生物群落的演变过程。DGGE图谱表明，人工接种菌株成为堆肥高温期优势菌株。人工接种增加了堆肥中微生物总量，提高了堆肥微生物种群多样性，并且促进了堆肥菌群演替，从而缩短堆肥腐熟时间(徐大勇等，2006)。
Bolta等研究了有和没有微生物接菌剂对于堆肥过程中微生物群体结构的影响，指出与不接种处理相比，用处于活性阶段的堆肥作为接种剂，堆肥在2d后达最高70℃，可以加速有机质的矿化，产生具有适宜C/N比的堆肥产品(Bolta等，2003)。
Singh等利用侧耳属、哈兹木霉和圆褐固氮菌属的菌株组合接种于园林固体废弃物中，结果用接菌剂处理的堆肥的质量明显高于没有接菌剂的堆肥，木质素、纤维素和半纤维素含量显著减少；同时他们指出，在木质纤维素降解过程中，用白腐菌处理，去掉保护的木质素外壳可以加速纤维素水解，所以，接种这些微生物，通过降解废物中不易被微生物攻击的木质素，减少木质素的比例，可以加速降解过程(Singh，2003)。
spelavelikonjaBolta等人(2003)研究表明，在堆肥活跃期接种微生物能提高堆肥效率，接种微生物的堆肥在2天后达最高温70℃，有机质的矿化更为有效，产生的堆肥产品生物学更稳定。
根据国内外的多数研究结果，可以认为，接种菌剂可以使堆肥物料快速达到高温、控制堆肥过程中臭气的产生，缩短堆肥腐熟进程，可以有效杀灭病原体和降解有机污染物，提高堆肥质量；堆肥产品含有生物活性的微生物，作物增产效果显著(冯宏等，2004)。
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