答：通过多年的实践证明，使用发酵床复合菌这种专业的发酵床菌种是完全可以给猪使用抗生素和对垫料进行消毒处理的。活力发酵床垫料本身也对各种病原菌起到很好的抑制杀灭作用，使用发酵床养猪基本不用担心病原菌的残留问题。下面我们就从实践和理论上来进行分析，再用实例来给大家说明。
首先第一个问题：在饲料中使用抗生素药物，或给猪打抗生素针剂，是否会影响垫料正常发酵功能，答案是不会，养殖户可以大胆使用抗生素或注射药物，该怎样使用就怎样使用，丝毫不会影响垫料的发酵进行；
实践是检验真理的唯一标准，也是最有说服力的依据，即使是治病时的大剂量的抗生素用量，也不至于影响到垫料中的微生物发酵，这一点在活力发酵床应用的四年多的时间内，均已在实践中证明了这一点，实际上，我们的大部分发酵床养殖户已经在实践中了解到了，在治疗猪病时，并不会影响发酵床的分解功能。
② 第二：即使是排泄出来的抗生素，通过猪的拱翻垫料，与垫料混合在一起，从而起到了稀释抗生素浓度的作用，实际上至少稀释了10倍之多，试想，稀释了10倍的排泄抗生素，会有多少抑制发酵的作用呢？答案是极少有抑制作用了；
③ 第三：我们的活力发酵床复合菌活力极强，这与活力99生酵剂传统的高发酵力同出一门，有相似的发明理念，但菌种组合主要为：枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、乳酸粪肠球菌、屎肠球菌、反硝化细菌、硝化细菌、产朊假丝酵母菌、嗜热侧孢霉菌等复合菌种，同时添加有活力99特有的强力促酵助剂；
④ 第四：在多菌种发酵床菌剂中，抗生素的抑制作用往往有限，或换句话说，抗生素的抑菌范围和抑菌浓度对活力发酵床复合菌中的不同菌种是不同的，总会有部分菌非常活跃，例如抗生素对其中的真菌类如产朊假丝酵母、和嗜热侧孢霉菌就没有抑制作用，在我们的实验室中可以证明，其实光是这两种菌就有较强的发酵和利用粪便的功能，以及改善垫料环境的功能，或者说， 在有抗生素的环境中，至少这两种菌是不受抑制的，并也有协同分解粪便的功能。
除了这两种菌外的其他细菌，虽然受抗生素的抑制，却并不是受所有抗生素抑制，例如我们的乳酸粪肠球菌就对维吉尼亚霉素和黄霉素不敏感，其实象枯草，地衣，侧孢，巨大，硝化与反硝化细菌，屎肠球菌等，都与粪肠球菌一样，都有对一部分抗生素不敏感的，所以，活力发酵床复合菌中总会有一半以上的菌种即使抗生素剂量非常大，也总会有不敏感的菌株要起作用。更何况如上所述，抗生素在垫料中被稀释了10倍以上，以及在动物体内衰减了一半左右等。
⑤ 第五：对于对付病毒的抗病毒药物，如盐酸码啉胍等，则更不会对活力发酵床复合菌中菌种活性有影响了，因为抗病毒制剂是针对病毒分子（蛋白质包裹的核糖核酸分子）而设计的，而病毒与细菌在结构上有着本质的区别，很多抗细菌的抗生素如青霉素就是根据抑制细菌细胞壁合成来杀菌的，但病毒却没有细胞壁，所以，抗病毒制剂根本就不是针对细菌，酵母，嗜热侧孢霉菌等设计的，所以，毫无必要担心抗病毒制剂会影响发酵床菌种的活性。
⑥ 第六：无论是抗生素，抗病毒药物，还是消毒剂，都是具有药效失活期的，就如同人吃的蔬菜，只要在喷了农药后的第七天后采摘，是完全安全的无毒的，这是因为农药的药效在七天后失效了，这都是一个道理，所以，消毒剂对垫料消毒，确实会在头几天影响到接触面的菌种，消毒剂只对上层薄层菌种有影响，但发酵床垫料系统是一个巨大的菌种储存库，只要猪还是拱翻垫料，里面的菌库必然会被翻上来，与此同时，消毒剂的药效也在慢慢失效，所以，菌库中的活菌翻上来后将继续传承发酵；
⑦ 第七：发酵床管理中，要求定期补充菌种，例如每半个月每平方米垫料补充1克活力发酵床复合菌，这也保证了垫料中分解粪便的菌种的活力和菌系平衡，和保证菌种的数量。
首先必须向大家讲清楚一个道理，就是发酵床提高猪的免疫力的原理：类似于我国中医原理那样的“扶正祛邪“的方法，即并不排斥邪的存在，通过提高人的机体免疫力，平衡阴阳，通脉络，并充分发挥人体自身潜力，来战胜疾病，讲究的就是一个字“中”，即平衡，发酵床养猪中猪的抗病原理正是如此，如果不能理解这一点，则您是无论如何无法理解发酵床是如何防病的，反而给人的印象就是发酵床恰恰是一个病菌病毒滋生的温床，而这是完全不对的。
其次发酵床垫料系统中，并不靠产生高温来杀死和控制病原菌，也不要指望靠产生高温来杀死病菌，因为高温就意味首发酵床菌种自己也会被杀死，也意味着猪难以渡过夏天（强烈的热应激），也意味着垫料消耗速度大大加快，需要频繁更换垫料，所以，高温杀病菌原理是行不通的，那么是靠什么原理呢？答案还是上面这一段内容的原理，即“平衡”原理。
我们检测得知：活力发酵床垫料中，每克垫料含有益细菌（特别是乳酸粪肠球菌等）达到3000万个/克，而有害的大肠杆菌类只有3000个/克左右，相当于有益乳酸菌类，是有害大肠杆菌类的1万倍之多，况且这些大肠杆菌类，并非全部都是致病性大肠杆菌，而大部分是条件致病菌，或者换句话说，即使猪吃了垫料，在吃进了大肠杆菌的同时，也同时吃进了1万倍以上的有益乳酸菌类，这就是菌系的平衡，这并不会直接导致猪产生大肠杆菌疾病，如拉稀。因为同时吃进去的有益乳酸菌类，会对大肠杆菌形成牵制的平衡作用，具体的益生菌如何在动物肠黏膜中起作用的，这方面的论述非常多，这里不再累述，只说几个简单的机理，如以下几条：
① 乳酸菌特别是原籍型乳酸粪肠球菌定植于肠黏膜上，形成定植抗力，占用了定植点，同时，连接成一片形成乳酸菌屏障，从而排斥有害细菌如大肠杆菌等；也排斥了大量的饲料中的抗原，如霉菌毒素，豆粕蛋白抗原，病毒病菌等抗原。
④ 生物夺氧说，如垫料中的枯草芽孢杆菌，地衣芽孢杆菌等，可以在肠道中迅速消耗氧气，营造有益菌生存环境，抑制有害细菌和病菌等，所以，芽孢杆菌类几乎是猪肠道疾病的指示菌（即猪生病时往往肠道有氧气混入，则在粪便中能检测到更多的芽孢杆菌）
⑤ 帮助动物消化食物，提高特殊的维生素营养，分泌生物抗生素如乳酸链球菌素等，也有提高动物机能，提高抗病力的效果。另外，乳酸粪肠球菌等产生的乳酸，维生素，小肽等，还能帮助猪只减少应激的发生，因为这些小分子营养物质几乎就是速补营养物质。
2.1.2 提高猪只对病原的平衡能力，发酵床是一个接触式免疫载体。
即通过环境菌系的平衡，提高猪的免疫力，从而提高抗病力；
活力发酵床环境是一个“相对卫生环境”，以对应传统水泥地养猪的“绝对卫生环境”，“相对卫生环境”是指垫料中有益菌对有害病原占绝对的优势，这种优势基本上在10000比1的优势（抽检结果），这也是一种“卫生环境”，如果不理解这种环境也是一种卫生环境，则就无法理解发酵床控制猪病的原理，而传统养殖由于一周消毒1～2次，力求全面杀菌，甚至也杀死环境中和猪体内的有益菌，这是一种“绝对卫生环境”；个人认为传统的“绝对卫生环境”往往造成猪免疫力低下，免疫系统锻炼不足，免疫记忆缺乏强化，免疫记忆贫乏，从而造成病来如山倒的普遍现象。
我们不必否认垫料中必然在某一时期（如猪感染疾病时），短期存在一些病原菌，甚至如链球菌，副猪嗜血杆菌，大肠杆菌，巴氏杆菌，沙门氏菌等，但这又如何，难道说普通非发酵床猪场就不存在吗，实际上任何猪场都存在这些病菌，甚至很多是猪体内的常在病菌，或叫常驻菌，只是处于隐而不发的状态，或者说是条件致病，一旦有外在的应激发生，隐而不发的病菌就会发作，所以说猪场疾病70%是由猪应激引发的继发感染和内源性感染。
如果发酵床能做到，在有病原菌存在的情况下，猪只不会发病，却能刺激和锻炼猪的免疫功能，强化免疫记忆，提高抗病力，又何乐而不为呢？
猪在几万年的进化过程中，其实早已适应和病原菌和平共处，只是人类不断地破坏这种和平共处的现状，不断消毒杀菌（一周一次，恨不能将猪舍搞成无菌室），不断给它服用抗生素，造成耐药性病菌不断增多，不断增强，甚至出现超级细菌，就是破坏了这种和平共处的原则，同时，也抹杀了动物自身存在的免疫潜力，和抵抗病原体的潜力，人类总想按自己的思路来工厂化生产生猪，结果只会适得其反，猪如果从出生开始一直在这种“一周1～2次全面消毒的无菌条件”下生活，往往免疫系统得不到强化，对各种病原的免疫记忆完全丧失，所以，一旦有外来病菌或应激引发的内源感染，往往一发而不可收拾，猪场全军覆没都是有可能的。
例如科学家试验表明，从一出生就完全生活在无菌环境中的白鼠（所有食物均高温消毒，环境无菌），其体内抗体水平极低，一放到粗放环境中存活率极低，相反，出生后生活在普通环境中的白鼠存活性生命力极强，抗体水平高。
所以，我们人类大可不必去破坏猪与生俱来的抗病潜力，猪适度的接触有害病菌，并非完全有害，甚至是有益的，但条件是在可控制的情况下接触一些病原，从而刺激猪只的免疫系统的发育，实际上打弱毒疫苗不就是这个道理吗？关键还是两个字“平衡”，实际上发酵床垫料中的病原和病毒基本上存在弱毒化倾向，致病性减弱，却能刺激猪免疫系统的快速发育和强化；
发酵床养猪就是营造这样一种养猪环境，让其回归自然，我们要做的就是保持垫料中有益菌必须占绝对的优势地位，有效控制有害菌就可以了，在这种情况下，猪往往不会发病，却能不断强化免疫记忆，锻炼免疫功能。
这就如同几乎所有的人都平时带有感冒病毒，但并不见得每天都感冒，只要保持良好的生活习惯，减少不必要的应激（如突然着凉），则不会得感冒的。
2.1.3 强化运动，优化养殖环境，平衡机体运动和协调能力，甚至是保持猪的心理平衡，保障猪的天然福利，减少应激，并最终达到抑制猪病的目的。
这一点是传统的水泥地面养殖，和集约化大规模养猪场完全做不到的，但活力发酵床养猪却可以做得到。
① 第一：满足猪的天然习性，例如拱土觅食是猪的天生采食形为的一个突出表现，猪的上唇短而厚、鼻子高度发达，二者连在一起，构成了一个坚硬的吻突，能掘地觅食，这些遗传特征在方便觅食的同时，也连带进化到可以刺激猪的消化系统，如猪的吻突在与地面或垫料摩擦的同时，能刺激消化道分泌消化液、促进食糜的消化，同时还能刺激脑垂体分泌促卵泡素促进母猪的发育和发情、并增强体质、锻炼蹄角，这对维持母猪的生产性能十分重要。
所以，采用发酵床可以满足猪的这种天性，但传统的水泥地面养猪却无法满足猪的这种天性，甚至使猪本身存在极大的心理障碍。
② 第二：猪适当的接触自然或准自然环境（如玩耍发酵床垫料），适当运动，对协调机体繁殖性能、强化相应器官的神经系统与肌群有极大好处，并对饲料消耗影响并不大。
最简单的例子就是哺乳动物的神经与体液调节功能在动物一生中是至关重要的，特别是与母猪的繁殖性能直接相关，神经与体液调节功能的完善与协调是动物个体在长期的生长发育过程中，以及进化过程中逐步形成和建立起来的，是在动物个体与复杂的环境不断地进行物质交换、能量与信息的交换中逐步完善的，这种调节功能集中表现在动物性成熟后，能够良好地表达种的延续的行为，集约化养殖环境中的母猪，缺乏与复杂多变的环境的信息交流、缺乏与其他个体和群体的广泛的信息交流（如限位栏中的母猪），神经与体液调节的能力不仅表现在对外界环境的协调性较差，还表现在对内源环境的变化（如分娩、哺乳）的适应性差，出现相关激素分泌不足或靶器官敏感性差，临床上用相关的激素或用能提高子宫兴奋性的药物，或用能提高子宫血流灌注量与携氧量的方法均能缩短产程就是佐证之一。
发酵床具有相对集约化养殖场而言，更为广泛而复杂的成长环境，甚至类似于猪等祖先所生存的环境条件，而又相对“干净卫生”，这种相对卫生是指有益菌群相对有害菌群占据绝对优势的情况下成立，充分利用和发挥了大自然给予猪等哺乳动物的自体免疫系统的潜力，发挥了猪自体协调功能，减少了集约化条件下的大量应激行为。
③ 第三：高密度养猪中常可以看到猪的怪异形为，如咬尾、咬栏、拱烂水泥地面等，都是漠视猪的生理福利的重要反馈。
同时，母猪在集约化条件下缺乏运动是公认为事实，直接造成心肺功能的减退、有关肌群能力的减退也在情理之中，并且这种退化直接反应在集约化养猪中，造成了种的延续的困难；例如母猪分娩是在中枢神经系统的控制下，通过神经与体液调节，全身参与的种的延续的行为，其中腹肌的收缩力、后躯的发育、荐坐韧带与软产道的弹力，呼吸肌与膈肌的健壮程度都对分娩有重大的影响，而在限位栏中的母猪在这方面都有弱化的危险。发酵床的母猪在这方面则可以获得极大的优势，原因是不言而喻的。
从这一角度来看发酵床，这也是为什么我们强调发酵床养殖应该从母猪开始养起，母猪有着发育良好的免疫系统，可以在发酵床中轻易获得多种后天免疫抗体，并达到一定的抗体水平，并可以通过母猪初乳传递给仔猪，让仔猪一上发酵床首先就非常适应发酵床的新环境，这是最重要的一点。让发酵床上的新生仔猪尽早吃到母体初乳也是非常重要的。
3、至于病毒更不是影响发酵床效果的主要因素
病毒说到底，它是寄宿性的，只有在宿主体内，它才有活性，离开了宿主如猪的身体，病毒是毫无活性可言，离开了宿主进入垫料后，它就仅仅是一个由蛋白质分子包裹的核糖核酸大分子，在垫料环境中的其他有益菌影响下，在环境中温度湿度和酶的影响下，它的结果只会是慢慢失活死亡，以及弱毒化等，至于毒力反强现象以及增殖现象，只发生在宿主的猪体内，不会发生在垫料系统中，这些都常识。
当然这些常识恰恰是很多养殖户不太明白的地方，常听一些养殖户反问我们：“有害细菌好对付，病毒很历害，这可不容易对付吧？”其实恰恰相反，在垫料系统中，病毒无足轻重，反而是病菌难对付一些。
垫料中即便是残留有抗病毒药物和病毒体，都不直接影响垫料中微生物的发酵功能，因为这几乎是风马牛不相及的不同东西，
4、最后再说明一下，如何来确实保障活力发酵床垫料系统中，有益菌占绝对的优势，或者说长期保持一个有益的菌相平衡状态，从而保证达到上面所说的各种平衡。
首先要说的是，发酵床养殖绝对不是完全可以不管的懒汉养殖方式，还得养殖户细心管理才行。
猪体对发酵床垫料环境排毒是避免不了的，即便是看似健康猪，也不能排除其带菌的可能，同时也说明，在猪长期与病原体的对抗和相处的过程中，它们之间是可以和平共处的，但必须有前提条件，即
① 猪的应激少（猪的福利高，有玩耍等，如发酵床模式；避免不同母猪来源的小猪并栏或采用小栏饲养；运输、转栏、并栏合理；饲养员态度温和；注意保温或降温；空气洁净对流等等）；
② 环境微生态相对干净，微环境中有益细菌占绝对的优势也是一种相对卫生干净的环境，如发酵床就是这种情况；同时建议饲料中添加保健液或添加“强微全价酵素1号”1000克/吨等微生物制剂，以使体内肠道系统中微生态环境中有益菌占绝对优势。
③ 环境温度湿度符合猪的生理需要；即冬天保温或升温处理，夏天通风降温处理；
④ 饲料营养均衡，全价，能够满足猪的日营养需要；无霉变，或加防霉剂等。
⑤ 饮用水源干净卫生，并且充足；。
⑥ 尽量控制蚊蝇鼠蟑等虫害；同时，注意外来人员生物安全性等。
⑦ 经常使用饲料脱霉剂产品，特别是温湿气候条件下，因为国内玉米往往无法保证无霉菌毒素侵害；
⑧ 在寄生虫的控制方面，坚持四加一驱虫模式，则完全不必担心这个问题，四加一驱虫模式就是种猪母猪一年统一驱虫四次，育肥猪则在60日龄时驱虫一次，要形成规章制度，常态化制度，万不可仅仅是在发现有寄生虫时才驱虫，这种四加一模式是科学研究了猪体内寄生虫的繁殖周期规律而设计的，即虫卵从孵化到成虫一个周期是3个月，所以，种猪母猪一年驱虫四次，而育肥猪在60日龄驱虫后，往往再过3个月就出栏了。
⑦ 严格按活力发酵床操作规范来选择垫料，和制作发酵床，保证发酵床垫料系统的合理化，如粗细搭配透气性好、吸水性好，有一定强度，垫料惰性不含营养物等四个垫料选择原则一定要坚持。
环境中病毒和病菌弱毒化，实际上发酵床上的病毒病原体都存在弱毒化趋势，例如我们监测的猪粪中的大肠杆菌进入发酵床后，数量一直在减少，本身受到抑制，实际上也是一种弱毒化的表现，病毒则离开宿主后，按自然规律，其毒力变弱是自然而然的事，并直至死亡，毒力的反强现象只存在于宿主体内。
以上在活力发酵床操作技术规范中都有规定，完全能够做得到，在这些前提条件下，猪与病原体共处，猪后天获得性免疫力的潜力大，猪的抗病力强，当然，也如前所述，发酵床不是完全的懒汉养猪法，同样必须加强管理。
5、所以说活力发酵床在控制猪病方面，平衡是关键
发酵床控制疾病主要靠的是微生态平衡，或微生物之间的制约，利用占绝对优势的有益菌，特别是猪肠道原籍菌如双岐乳酸杆菌，乳酸粪肠球菌等来制约有害病原菌和病毒，不仅在体外的垫料中形成相互制约制衡的关系，在猪的体内也是如此，即使猪吃进了含病菌的垫料，但同时，也以10000倍以上的比例吃进去了有益的肠胃原籍菌，它们在一起就不会发病；
很多人很难理解这样一种制约原理，但其实很简单，大量的科学试验表明，在动物的肠黏膜微生物系统中，（要知道肠黏膜系统中存在1000克以上的微生物菌体重量），病原菌和病毒也是存在的，但并不引发疾病，如条件性致病性大肠杆菌，它往往能强烈地刺激动物黏膜免疫反应，促进黏膜的体液免疫和细胞免疫，产生大量的特异性和非特异性抗体，这种由有害病菌直接刺激产生抗体的作用，甚至远远大于肠胃原籍菌引发的抗体反应，肠道原籍菌甚至并不引起动物或引起极少量的抗体免疫反应； 所以，在体内适当地存在有害菌和病毒，对锻炼提高动物的抗病力是非常有益的，科学家试验表明，从一出生就完全生活在无菌环境中的白鼠（所有食物均高温消毒，环境无菌），其体内抗体水平极低，一放到粗放环境中存活率极低，相反，出生后生活在普通环境中的白鼠存活性生命力极强，抗体水平高。
然后是猪的身体机能的平衡，生活习性的平衡，并照顾到猪的生理福利等。
2 建设成本高，猪舍占地面积大，100平方米只能养50-70头猪(每头猪占地面积1.5平方米)，而目前规模化养猪可饲养100头，现有的猪舍不能用，要一大笔费用来改造(要垫3尺厚的锯木，而且要杂木的)。
答：采用直接接触垫料的传统发酵床养殖，最大的缺点就是养殖密度比较低，比传统的水泥地养殖密度几乎要小一半的，地方利用率低。为了解决这种发酵床养殖的这个缺点，我们现在已经发明出一种猪不接触垫料的发酵床养殖技术，完全解决了接触垫料式发酵床存在的缺点，并成功申请多项技术发明专利。
这种技术采用高架床技术，猪不直接接触发酵床垫料，猪生活在漏缝板上面，下面铺上30~50公分的发酵床垫料，在发酵床垫料上安装一个自动翻耙机，完全不用人工翻耙垫料，这种新型的发酵床技术特别适合大型养殖场实施，它可以高密度养殖，而且完全不用人工翻耙垫料，而且对垫料的要求不高，垫料保持蓬松状态，通透性好，粪便的分解速度明显提高。
接触式发酵床养猪其实特别适合于中小规模养殖户，并特别适合于保育和小猪的养殖，对猪的健康和生长速度都比传统水泥地面的效果好得多，但到了大猪阶段，则分为以下两种情况：
① 如果您的土地资源充足，则建议大猪发酵床养殖采用2平方米一头大猪的密度，充分照顾到了猪的自然福利，比传统水泥地面养猪的效益更好，发病率降低，养殖环境不臭，无排放，更健康，猪肉品质好，能满足分解粪便的需要，是政府鼓励的生态养殖模式；
② 如果您的土地资源比较紧张，则建议大猪阶段仍然采用传统水泥地面养殖模式；
3 养猪成本不一定能下降。有些发酵床养猪法的推广者强调一次性喷洒菌液可以维持很长时间的菌种生长。要知道，菌种的生长是和垫料的组成以及温湿度直接相关。就目前所呈现的比较粗犷的垫料组成(甚至垫料的组成成分还可以根据当地资源进行调配)，能否对菌种的生长提供适宜的条件呢?显然不行，那就需要定期喷洒，但菌液的成本代价又是非常高的，因为对浓度要求比较高，势必会增加成本。另外，猪在猪栏活动范围大，跑来走出消耗能量，饲料转化率可能下降。
答：可能是目前市面上存在着成本非常高的发酵床菌种，给大家造成了个误解，目前在国内，有多达十几个的发酵床菌种，菌种的成本及使用效果存在差别，甚至会很大，特别是成本，有的相差到10倍甚至更多，绝大多数菌种的制作成本都在10元以上一个平方，而且维护的成本也不低，那有没有一个低成本而且使用效果非常好的菌种呢？
肯定地告诉大家，有这样的菌种，它就是“强微发酵床复合菌”，由江西宜春强微生物科技有限公司研制生产，制作的成本每平方仅仅是3元，维护成本更低，每20个平方米面积一年的维护菌种成本不超过5元，发酵床菌种成本远比国内的同行低，而且使用的效果一点都不差，每克垫料中有益微生物的浓度达到了千万的数量级，每克垫料含为3千万个有益微生物，比一般同行的菌种每克垫料的有益微生物浓度多10倍。
活力发酵床复合菌的菌种组成上也有大多数公司有所不同，最大的特点是具有生物脱氮功能，因为粪便中的碳氮比只有14比1，而正常的饲料或微生物最适宜的碳氮比是25比1，所以，粪便中的氮源过多，有脱氮功能的活力发酵床复合菌可以把多余的氮变成氮气挥发掉，从而保证发酵床中的微生物的可持续发酵，垫料的使用寿命大大加长，而且我们认为这是发酵床菌种的一种必需的功能；第二就是活力发酵床复合菌的菌数非常高，所以，使用量小，活力高，并添加了高活力高密度的乳酸粪肠球菌，特别适合于分解粪便使用，可分泌乳酸并维持垫料的酸碱度平衡，保持有利于有益微生物的生长环境。平时维持发酵床补充菌种时，只需要每半月每平方米补充一克就可以了。
那种认为发酵床养猪必然料肉比过大的想法是片面的，值得商榷，发酵床养猪显著提高了猪的健康水平，比之传统水泥地面养猪的健康状态更好，肠胃功能更好，所以，虽然运动量加大，却并不一定会消耗更多的饲料，比如一头健康活泼和消化功能更好但运动量多一些的猪，和一头长期处于亚健康状态的但运动量少的猪，在料肉比方面并不见得是后者的更好，传统的养猪特别是工厂化养猪，猪的生理和心理状态都处于亚健康状态，免疫和抗病功能低下，耐药病菌多，长期在抗生素等药物浸泡中养殖长大，甚至是限位栏养殖，猪的天然习性（如拱翻垫料或泥土的习性）得不到满足，表现在其消化功能并不好，食欲不旺本身就说明消化液分泌不旺盛，所以，实践的结果是发酵床中的猪反而消化功能更佳，料肉比略低。
4 发酵床是靠木屑、米糠等粉状物吸收猪的排泄物，而猪有拱食的习惯，木屑、米糠等粉状物会因为猪 拱食物进入呼吸道，造成呼吸道疾病。
答：这种情况应该是有存在，但不是必然的，发生这种情况，是因为管理不到位，让表层的垫料太干，起粉尘，被猪吸入了呼吸道。实际当中，只要维护好垫料的含水量，不要让垫料过干，完全可以避免吸入垫料造成的呼吸道病。
还有一个方法能更加完全解决这个问题，那就是如果采用了猪不接触垫料的新型发酵床养殖技术，猪完全不接触发酵床垫料。
5 发酵后在垫料中存在着大量的霉菌毒素，猪有拱食的习惯，猪只采食霉菌毒素后,常引起免疫抑制，抵抗力下降，饲料报酬不升而降。
答：这种情况有可能会发生，与发酵床的使用的菌种，制作的方法，使用的垫料，垫料使用时间，还有与季节与天气有关系。
发酵床垫料湿度过大或过小，发酵床垫料久置不用，垫料使用的时间过长，空气湿度较大的春天梅雨季节，以及使用了霉菌宿主原料如玉米芯或是花生壳等为作发酵床垫料等都相对容易使发酵床垫料产生霉菌。
预防和解决的办法是选择合适的发酵床垫料材料，控制好垫料的含水量，解决办法是在垫料加入脱霉剂，如果采用猪不接触垫料的新型发酵床技术，那更是从根本上解决了猪食用霉变垫料造成的霉菌毒素中毒问题。
维持良好的发酵床管理，使用和补充繁殖性能好的发酵床菌种，经常有猪在上面拱翻垫料或人工辅助翻料，可以极大减少霉菌菌丝繁殖的机会，长期搁置的垫料在再次使用前建议打堆覆盖发酵几天可以彻底消除其中各种有害因素的影响，包括霉菌的影响。
6 夏季猪舍内温度过高，影响猪的生长发育，日本是高层养猪，很多猪场猪舍内均装有空调，而发酵床养猪猪舍内发酵起来温度太高，夏天不利于猪的健康生长。特别是在我国的南方地区，本来气温就很高，发酵散热虽然表层温度并不高，但使猪所处的环境温度上升，猪只生长速度缓慢、饲料报酬有所下降。
答：在夏天度夏的问题上，发酵床的确是遇到难题，特别是垫料消耗快，产热量很大的菌种，垫料的湿度达到60~70度，猪根本受不了，所以只能是留一部分的水泥地面。在这方面进行了多项创新发明，发酵床虽然没有留水泥地面，但是还是能很好的让猪顺利度夏，而且猪很少出现热应激。
首先是发酵床菌种，发酵床复合菌是一种温和型菌种，只会分解粪便，几乎不会解决垫料的粗纤维，所以垫料的消耗速度慢，垫料的温度不高，为解决夏天温度过高垫定了很好的基础，然后再使用垫料分区技术，夏天猪在薄而谅快的垫料层上，冬天猪在深层的垫料层上面。
在南方地区，其实传统的水泥地养殖，夏天也会遇到过热问题，因为在南方地区，最热的时候，就是空气的温度也有40度，只是水泥地面养殖，可以冲水给猪洗澡降温，而发酵床不能象水泥地养猪一样冲水降温，但是可以喷雾降温，这个喷雾降温也是活力发酵床为解决夏天度夏问题而创新的技术之一，每天定时多次给猪栏喷雾降温（采用雾化技术），则发酵床垫料的湿度基本上不受任何影响，同时加强通风换气，基本上解决了发酵床上的猪夏天热应激过大，甚至是难于度夏的问题。
7 床面湿度必须控制在 60% 左右，湿度过低不利于微生物繁殖，并会导致猪发生呼吸系统疾病，而湿度过高猪寄生虫病危害严重，猪在啃食菌丝时将虫卵再次带入体内而发病，而且皮肤病危害严重。
答：要让发酵床能很好的发挥作用，的确是要有一个合适的湿度，问题中所说的要求床面湿度在60%是错误的，一般要求中间层有50~60%的含水量，而表面层湿度为25~30%，这个范围是比较好的，能正常的分解粪便，而垫料也不容易板结，而且也不会起粉尘让猪呼入垫料导致容易得呼吸道病。
大量的养殖实践证明，只要养殖密度合适，控制合适的湿度并不难，而且寄生虫也并不见会高发，而且猪的皮肤病不但不会严重，还会特别少，猪的皮肤非常漂亮，甚至有些原来皮肤有病的猪一放到发酵床上后，皮肤病自动好了。因为发酵床垫料存在着大量的有益微生物，猪每天都睡在这个有益微生物的温床中，连原来的皮肤病都自然好起来。
在寄生虫的控制方面，坚持四加一驱虫模式，则完全不必担心这个问题，四加一驱虫模式就是种猪母猪一年统一驱虫四次，育肥猪则在60日龄时驱虫一次，要形成规章制度，常态化制度，万不可仅仅是在发现有寄生虫时才驱虫，这种四加一模式是科学研究了猪体内寄生虫的繁殖周期规律而设计的，即虫卵从孵化到成虫一个周期是3个月，所以，种猪母猪一年驱虫四次，而育肥猪在60日龄驱虫后，往往再过3个月就出栏了。
8 发酵床养猪法猪群转群较为不便，饲喂也较麻烦，如果没有配合较先进的饲喂设备，饲养员的劳动量不一定能降低。
答：这个问题可以说不存在，育肥猪的生长期不长，完全可以都在发酵床上，长期呆在发酵床软垫料上，当走到栏外的水泥地面时，可能有部分猪走路不习惯，但是这种情况只会发生在体重很大的大猪，而大猪一般很少转移，要说转移那就是出栏了。需要转栏的小猪不会出现这种情况。
至于饲喂方面，虽然不能象水泥地面那样可以撤料，但也是一点问题都没有，而且也不会造成劳力的增加，只要在走道那边做个料槽就可以了，一样饲喂很方便。
9 由于猪舍是半开放式的，受外界的环境变化的影响，如何使菌种在不同的气候条件下都能发挥较高的效率也是一个需要解决的问题。而且单位面积饲养猪的头数过多，床的发酵速度就会降低，不能迅速降解、消化猪的粪尿。根据目前我国的实际情况，大规模推行发酵床养猪法仍值得探讨，客观地说，目前发酵床养猪法比较适合我国北方地区规模较小的养猪户(场)应用。
答：这个说法有一定的道理。发酵床垫料其实受外界空气的温度影响是比较少的，因为发酵床垫料本身就是一个产热体，它有能力维持一个相对稳定的垫料层，在东北三省的活力发酵床养猪户中，室外空气温度为零下十几度，而在四周密闭的发酵床猪舍内，雾气腾腾，空气的气温能达到10度以上，垫料的温度有二十度以上。当然，越是冷的地方，要求的垫料厚度越高，垫料必须有一定的厚度才能自成系统，形成一个产热和保温的系统；
发酵床单位面积是比传统的水泥地养猪的头数要少，这个是事实，所以不太适合密集型的大型养殖场，发酵床一般适合场地较宽裕的小型养殖场，或是对环保压力特别大，而愿意牺牲养殖密度的中型养殖场，或是特种猪的养殖场。
大型养殖场也可以采用发酵床零排放养殖，可以采用不接触垫料式新型发酵床养殖技术。这种发酵床养殖技术，有养猪、养鸡，还有养鸭的，养猪的发酵床猪不直接接触垫料，猪生活在漏缝板上面，下面铺上垫料层，垫料层上面装个自动翻耙机，自动翻耙垫料，完全不用人工翻耙垫料。
10 垫料使用多年会可能会造成重金属的问题
答：首先要确定的是动物饲养所适用的钠、铜、铁等均不属于直接危害健康的类别（如铅锌等才是），垫料使用的菌群是复合型的，研发时就考虑到分解重金属的要求，虽然不能完全分解，但使用三年后的垫料通过检测重金属含量是在可以接受的范围，用于施肥果蔬植物没有发现高渗透压等不良情况。
实践中，南京农业大学李娜研究证实，镇江使用多年发酵床数据为：猪粪便干物质铜含量为350mg/kg，使用一年的床上层垫料中铜含量为260mg/kg，使用三年的发酵床垫料中的铜含量为380mg/kg。
仍然以一个20平方米栏养10头猪计算，经这位业界人士计算，一年养三批猪，一共排泄的干物质量是4000公斤，按文献检索，猪粪干物质中平均含铜为0.04%（即400ppm），即每年有1600克铜排放出去。
① 以传统养猪为例，猪粪也还得经过处理才能用作农家肥料，不然的话，对环境是有害的，也对农作物会造成烧根的危害，如果采用沼气池的处理方法，由于甲烷、二氧化碳、氧化亚氮、硫化氢等的排放，最终剩下的沼渣及液约为1200～1700公斤左右（具体看发酵的充分程度和发酵的时间长短），我们取1500公斤为例，则其中的铜被浓缩到1.6÷1500=0.11%的浓度。
即使是堆肥，堆肥发酵后也最终剩下最多2000公斤，则最终铜的浓度为0.08%。
或者说，传统养猪用于农家肥的猪粪中的铜含量为0.08～0.11%之间。
② 现在以发酵床为例， 假设发酵床垫料使用三年，则三年一共有4800克铜在垫料中富集，最终垫料总量为2800公斤（实践中估计值），则铜的浓度约0.17%，相对于传统模式中的堆肥中的0.08%确实浓缩了2.1倍，（相对于沼气池模式的0.11%浓度，则只浓缩了1.5倍），所以说，发酵床养殖中铜的排放浓度，至少并没有达到非常恐怖的数量级，而且由于发酵床中高活力微生物的发酵处理，螯合了一部分的铜（起缓释作用），降低了铜的生物效价（毒副作用）。
而且必须清楚的是，这是使用了三年的垫料，如果只使用一年，则实际上铜浓度只有1.6公斤÷1670公斤=0.096%，与传统的0.08～0.11%相差不多。
③ 但若使用五年，也不得不承认，垫料中铜的浓度被浓缩得较大了，这需要在做肥料的时候，与其他农家肥掺合着使用为宜，或减少用量，如根据苏秋红的研究，发酵粪便中铜含量在1000～2000ppm浓度时，每亩耕作土地或菜园土地，施用发酵粪肥（湿基计）控制在1吨之内，则连续施用3年，仍然可以达到国家《土壤环境质量标准》GB15618-1995 的要求，从三年的连续施用情况表来看，土壤中铜的含量并未呈现出上升趋势，或者说，施用的肥料中的铜元素可以和耕作物的吸收速度达到某种动态平衡，这个用量是安全的。
④ 现时有很多的农业专家鼓励和推荐猪粪利用时，与秸秆（如稻草）等混合发酵，降低铜的浓度含量，原因很简单，自然界中以秸秆树木等的植物中铜含量最低，这些材料是稀释铜的绝佳材料，同时在堆肥或发酵时，可以大大降低铜的生物效价，或铜可以被最大限度地整合或螯合到有机物中去，而发酵床的菌种中，大多数菌有极强的螯合能力，以及产生有机酸的能力，这些措施都可以大大降低铜的负生物学效价。
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