发酵床的常规维护管理同上面讲的育肥猪发酵床栏舍的管理方法基本是一样的，但要求母猪发酵床的表面层要更为干爽一些，表层垫料的含水量更低，只需要25%以内即可，维护的标准就是不扬尘即可，冬天基本上不用洒水，但要根据情况决定是否需要补充菌种，即保健液；夏天则视情况加保健液和水于垫料中，怀孕期母猪注意后期要单栏饲养，注意冬天还可以放点软垫草于发酵床表面。
母猪怕热，夏天太热时，注意机械降温如通风降温、喷雾降温等措施。
后备母猪栏可以放一些玩具供给猪玩耍，如塑料彩球等，以增强体质和抗病力。
除了按常规发酵床的管理方法来处理粪尿外，还需要特殊的管理，如下：
如果是外购进来的后备母猪，则必须在隔离舍（注：隔离舍由于经常用于外购后备母猪的隔离饲养，所以栏内的微生物菌群处于不稳定状态，毒株也不稳定，隔离舍不是发酵床模式，且要远离发酵床饲养场的栏舍）进行观察饲养。
外购后备母猪需要在隔离舍饲养6周（一个半月）以上，进行观察（行动能力、粪便情况，精神状态，吃料情况，呼吸情况等）；同时进行免疫，第一、二周进行减少应激的准备工作，如添加电解或免疫多维于饲料中，饲料使用后备母猪料标准配制或购买商品料，不能使用生长肥育猪料，180日龄前自由采食，180日龄后，适当限饲，以保持体况，不肥不瘦，日喂量2.5千克。后备母猪6月龄是性发育的关键时期，饲料中应注意添加维生素E、胡萝卜素、蛋白质、矿物质微量元素等，栏舍中经常使用活力99保健液兑水50倍进行喷雾,造成有益微生物环境。
然后进行免疫接种，（猪瘟/伪狂犬，口蹄疫，乙脑/细小病毒），同时进行驱虫处理；第三、五周，进入适应期，将原有猪群的母猪并入后备母猪栏，同时也可以取本场母猪舍发酵床中的部分老垫料，放入隔离舍中（进行微生物环境适应），或将胎衣浸水24小时后，喂后备母猪，以使后备母猪通过自然接种，来对原有猪群的病原微生物产生天然免疫；然后才能进入配种舍的后备母猪栏（此时为发酵床饲养）中进行饲养。
后备母猪快进入发情期时，如7～8月龄时，饲料最好选择哺乳母猪料的标准来喂，以利于催情，促进卵成熟，配种前2周，实行增料，达到3～3.5千克/天，配种后，恢复2.5千克/天，配种后才用妊娠母猪料。
建立人与猪的和睦关系，饲养员平时工作时，如饲喂时进行口令和触摸等亲和训练，而不能随意打骂它们。这样母猪愿意接近人，便于以后配种、接产、哺乳、打针等操作管理，同时可以减少应激。
后备母猪经隔离期后，赶入配种舍的后备母猪栏（发酵床栏）中进行饲养，稳定后，可以把小公猪赶入进行初情诱导。
如10月龄左右的小公猪，性欲旺盛，肢蹄结实，后备母猪发酵床栏中每群5～6头，每次接触15分钟后，后备母猪栏与小公猪栏应保持一定的距离，每天可进行两次诱导，后备母猪饲喂量建议每头2.5～3千克/天.头，每天检查发情情况，并作好记录。
后备母猪160～180日龄就可以进行试情。将其赶到公猪栏进行试情诱导。
后备母猪配种前40～50日龄接种“猪瘟/伪狂犬疫苗”，隔20天加强免疫一次；配种前30天接种口蹄疫苗；配种前20～30天接种乙脑/细小病毒疫苗，隔15天加强免疫一次。
也就是说：猪瘟、伪狂犬、口蹄疫、乙脑、细小病毒，需要接种。再根据当地疫情，选择性地进行其他免疫接种。
驱虫处理：母猪配种前用阿维菌素驱虫粉或伊维菌素驱虫粉（即动物体内外杀虫王）驱虫1次。公猪每年至少用阿维菌素或伊维菌素驱虫4次,交替使用。
适时日龄为大于210日龄，体重120～130千克，P2点背膘厚：16～18毫米（3～4分膘情）；第二情期以上才能进行配种（这是因为母猪第一情期，即初情期的卵子发育不完全所至）
进入配种阶段后，让后备母猪、断奶空怀母猪自由采食，每头每天3～3.5千克饲料，提高膘情（3～4分膘情），有助于发情，并可增加排卵数量。
该阶段的饲养管理要点：发情（试情）观察，和组织配种，减少断奶到配种的时间间隔，减少无效生产天数。
发现母猪出现静立反射立即配种（因为我们所看到的母猪静立反射不一定是第一时间出现的），即上午发现静立反射，当天上午配种一次、下午配种一次；下午发现静立反射，当天下午配种一次、第二天早上配种一次、下午再配种一次。
人工授精的精子活力必须在0.7以上，每头份精液80毫升、有效精子数30亿个。这样配种分娩率可以达到88%以上。
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